Finalmente anche a me l'antivirus ha dato la segnalazione relativa ai Trojan. Sto analizzando la questione e ad un primo esame sembra proprio che i Trojan non siano nelle pagine del sito, ovvero nei nostri file, ma nei file dei banner e per la precisione di un banner specifico: "ADSL 7mega aruba.it".
Stando al rapporto del mio antivirus trattasi di trojan non particolarmente dannosi (la segnalazione è dovuta al salvataggio dei file temporanei, basta fare pulizia di questi per rimuovere ogni traccia del trojan, certo è utile avere anche un software di blocco sulle impostazioni del browser), provo ad analizzare la cosa anche con altro antivirus e altre basi dati e poi spero di poter essere più preciso.